Komada等用配體親和層析法和免疫親和層析法將牛肺巨噬細(xì)胞清道夫受體純化，并從部分氨基酸序列克隆得到Ⅰ、Ⅱ型清道夫受體cDNA。隨后相繼克隆了人、小鼠的清道夫受體的cDNA，三種動(dòng)物的Ⅰ型受體的氨基酸序列一致性為64%～81%，Ⅱ型受體一致性為60%～84%。除了體內(nèi)巨噬細(xì)胞、體外表達(dá)的清道夫受體基因外，平滑肌細(xì)胞、肝細(xì)胞、內(nèi)皮細(xì)胞也存在著清道夫受體。

成熟的Ⅰ型清道夫受體由453個(gè)氨基酸殘基組成，Ⅱ型清道夫受體約由349個(gè)氨基酸殘基組成，不同動(dòng)物之間存在著差異。Ⅰ型和Ⅱ型清道夫受體在合成過程中，先合成亞基，然后再聚合成三聚體。雖然細(xì)胞內(nèi)可以分離到二聚體和三聚體，但只有三聚體具有與配體結(jié)合的能力。

清道夫的配體非常廣泛。包括:①乙酰化或氧化等修飾的LDL。②多聚次黃-嘌-呤核苷酸，多聚鳥嘌呤核苷酸，但是多聚腺嘌呤核苷酸和多聚胞嘧啶核苷酸不是其配體。③多糖類，如硫酸右旋糖酐。④某些磷脂類，如絲氨酸磷脂。但磷脂酰膽堿不是其配體。⑤細(xì)菌脂多糖，如內(nèi)毒素等。這些配體的共同的特點(diǎn)是多陰離子化合物，不過不是所有的多陰離子化合物都可作為其配體。由于Ⅱ型清道夫受體具有與Ⅰ型清道夫受體相同的功能，但沒有SRCR域，顯然配體結(jié)合域不在SRCR結(jié)構(gòu)域。